in Rahmen meinder Dr. Arbeit versuche ich RNA Expressionsdaten aus verschiedenen Datenbanken zusammenzufassen und auszuwerten.
Ich würde gerne eine Schleife erstellen, in der nun alle Variablen mittels Boxplot dargestellt werden ohne jedes Diagramm einzelnd zu erstellen.
Ich dachte es funktioniert wenn man die variablen oben in den GRAPH einfügt, aber das tut es leider nicht
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GGRAPH
/GRAPHDATASET NAME="graphdataset" VARIABLES=LeemBC44amplis RASGEF1AILMN_1661585 CCND1ILMN_1688480 CPT1AILMN_1687589 CPT1AILMN_1696316 CPT1AILMN_1710052
CTTNILMN_1744912 CTTNILMN_1798838 FADDILMN_1758658 FGF3ILMN_1723227 FGF4ILMN_1677456
GALILMN_1682015 IGHMBP2ILMN_1801909 MRGPRDILMN_1714980 MRGPRFILMN_1657502 MRPL21ILMN_1654250
MRPL21ILMN_1744835 MTL5ILMN_1661778 MYEOVILMN_1710875 ORAOV1ILMN_1762549 PPFIA1ILMN_1659948
PPFIA1ILMN_1727050 PPFIA1ILMN_1800164 SAPS3ILMN_1732725 SHANK2ILMN_1745151 SHANK2ILMN_1814790
TPCN2ILMN_1726873 MISSING=LISTWISE
REPORTMISSING=NO
/GRAPHSPEC SOURCE=INLINE.
BEGIN GPL
SOURCE: s=userSource(id("graphdataset"))
DATA: LeemBC44amplis=col(source(s), name("LeemBC44amplis"), unit.category())
DATA: RASGEF1AILMN_1661585=col(source(s), name("RASGEF1AILMN_1661585"))
DATA: id=col(source(s), name("$CASENUM"), unit.category())
GUIDE: axis(dim(1), label("LeemBC44amplis"))
GUIDE: axis(dim(2), label("RASGEF1AILMN_1661585"))
SCALE: cat(dim(1), include(".00", "1.00", "2.00", "3.00", "4.00", "5.00", "6.00", "7.00"
, "8.00", "9.00", "10.00", "11.00"))
SCALE: linear(dim(2), include(0))
ELEMENT: schema(position(bin.quantile.letter(LeemBC44amplis*RASGEF1AILMN_1661585)), label(id))
END GPL.
GGRAPHViele Grüße,
Merlin



